{"id":44,"date":"2006-06-01T20:32:48","date_gmt":"2006-06-01T18:32:48","guid":{"rendered":"http:\/\/www.schattenreigen.de\/schattenlog\/?p=44"},"modified":"2006-06-01T20:32:55","modified_gmt":"2006-06-01T18:32:55","slug":"fehlerbehebung-beim-perlmodul-statisticsr","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.schattenreigen.de\/schattenlog\/archive\/44","title":{"rendered":"Fehlerbehebung beim Perlmodul Statistics::R"},"content":{"rendered":"\t

Wer aus vielerlei nennbaren Gründen R<\/strong> einer gängigen Statistiksoftware vorzieht—und wer zudem aus Perl heraus mit R kommunizieren will, um z.B. die ganzen schönen Berechnungen einfach von Perl aus in R durchführen zu lassen, braucht das Modul Statistics::R. Eigentlich braucht man’s nicht unbedingt, weil man sich auch aus der Shell via Batchmode einigermaßen mit R verständigen kann.<\/p>\n\n\t

R CMD BATCH <\/span>[options] infile [outfile]<\/p>\n\n\t

So richtig schön wird’s aber erst mit dem Modul, das uns Graciliano M. P. glückerlicherweise zur Verfügung gestellt hat.<\/p>\n\n\t

Lädt man das Modul mit CPAN<\/span> auf eine der neueren Versionen von R, so hängt sich test<\/em> oder install<\/em> auf. Eine Fehlermeldung erscheint: Unkown GUI<\/span> none.<\/p>\n\n\t

Im R help archive<\/em> liest man dann nur sowas: “Habt Ihr etwa einen Code für eine frühere Version von R verwendet? Tsts!”
\nJa, haben wir wohl. Eine Lösung wäre für uns “User” indes viel hilfreichreicher gewesen und so:<\/p>\n\n\t

\"Link\" Re: [R] CGIwithR ERROR<\/span>: unknown GUI<\/span> none<\/a><\/p>\n\n\t

Hier ist deshalb eine Lösung, die nach einigem Rumprobieren bei mir auf einer SuSE 9.3 64 Bit funktioniert hat:<\/p>\n\n\t

1. Cpan anwerfen
\nEinfach das CPAN <\/span>Skript wie gewohnt starten.<\/p>\n\n\t

2. get Statistics::R
\nDas Packet herunterladen…<\/p>\n\n\t

3. make Statistics::R
\nAuspacken und so weiter….<\/p>\n\n\t

4. Veränderungen an dem Modul Linux.pm<\/em> durchführen.
\nDies sollte nach<\/em> make geschehen, sonst geht’s nicht, weil make wieder die ursprünglichen Dateien auspackt.
\nIm .cpan Verzeichnis nachsehen, wo Statistics::R ist. Darunter je nach Installationspräferenz eine der beiden folgenden Dateien editieren (oder halt beide—schadet nichts).<\/p>\n\n\t

lib\/Statistics\/R\/Bridge\/Linux.pm
\nblib\/lib\/Statistics\/R\/Bridge\/Linux.pm<\/p>\n\n\t

Zu ändern ist die Zeile:<\/p>\n\n\t

$this->{START_CMD} = “$this->{R_BIN}—slave—vanilla—gui=none” ;<\/p>\n\n\t

in:<\/p>\n\n\t

$this->{START_CMD} = “$this->{R_BIN}—slave—vanilla” ;<\/p>\n\n\t

5. test Statistics::R;
\ngucken, ob’s jetzt funktioniert.<\/p>\n\n\t

6. install Statistics::R;
\nNaja, irgendwann will man’s ja dann auch endlich wieder benutzen.<\/p>\n\n\t

Irgendwo habe ich nach langem Stöbern auch gelesen, man solle gui=none<\/em> durch gui=X11<\/em> ersetzen. Das habe ich probiert, jedoch mit vergleichbar unerfolgreichem Ergebnis: gleiche Fehlermeldung und Aufhängen vom CPAN <\/span>Modul wie mit gui=none<\/em>.<\/p>\n\n\t

Ich habe absolut keine Ahnung, ob dieser Workaround so richtig gut ist. Aber er funktioniert mit all meinen Perl-Scripten ohne Murren. Für Hinweise und andere (bessere) Ideen bin ich natürlich dankbar.<\/p>\n\n\t

Hier der CPAN<\/span>-Link mit dem einfachen und sehr nützlichen Modul Statistics::R von Graciliano M. P.:
\n\"Link\" CPAN <\/span>Modulseite von Statistics::R<\/a><\/p>\n\n\t

Und wer gerne mehr über R erfahren möchte:
\n\"Link\" The Comprehensive R Archive Network<\/a><\/p>\n ","protected":false},"excerpt":{"rendered":"\t

Wer aus vielerlei nennbaren Gründen R<\/strong> einer gängigen Statistiksoftware vorzieht—und wer zudem aus Perl heraus mit R kommunizieren will, um z.B. die ganzen schönen Berechnungen einfach von Perl aus in R durchführen zu lassen, braucht das Modul Statistics::R. Eigentlich braucht man’s nicht unbedingt, weil man sich auch aus der Shell einigermaßen mit R verständigen kann. So richtig schön wird’s mit dem Modul, das uns Graciliano M. P. glückerlicherweise zur Verfügung gestellt hat.<\/p>\n\n\t

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